Колонізація Сонячної системи стала для людства необхідністю. Техногенна катастрофа призвела до знищення всього живого на Землі, повноцінне життя на планеті неможливе, тому її пошуки продовжилися в космічному просторі. Гіперпросторові ворота дозволяють переміщатися між планетами в рекордно короткі терміни, що дозволило створити нові колонії, прискорило освоєння земель. Урядові структури надто пізно зрозуміли, що брамою користуються злочинні елементи з метою досягнення корисливих задумів. Зупинити їх можуть мисливці за головами, серед яких професіонали Спайк Шпігель та Джет Блек. Їм не звикати до сутичок з головорізами, але у хлопців є одне непорушне правило, яке вони дотримуються – на їхньому космічному кораблі Бібоп ніколи не буває сторонніх особистостей, але знайдений пес Ейн став винятком, як і першокласна шахрайка Фей Валентайн. Через деякий час ряди команди поповнив комп'ютерний геній Радикал Едвард, але напарники жодного разу не пошкодували про своє виключення з правил. Команда готова вирушити на пошуки запеклого злочинного елемента, дії якого можуть призвести до наступу Апокаліпсису, який колись стався на Землі. Напередодні Хеллоуїна на Марсі сталася трагедія: була застосована невідома біологічна зброя, і сотні людей загинули чи опинилися у лікарні. За голову терориста призначили нечувану нагороду, і команда «мисливців за головами» з корабля Bebop 268170 вирішила взятися за це вигідне завдання.