Наруто Узумакі був юним задиристим синобі, ходячим магнітом для неприємностей. Він пройшов довгий шлях, досягнувши того, чого так люто бажав - став Хокаге, найсильнішим ніндзею Селища Листя, увічнивши себе в історії всього світу. Однак ця історія не про нього.
З того часу минуло багато часу, і світ сильно змінився. Разом зі світом і спокоєм у Коноху прийшли сучасні технології — телебачення, хмарочоси, поїзди та багато іншого. Однак синобі нікуди не поділися, і їхнє життя також сильно змінилося. Син сьомого Хокаге Села Листя — Боруто вступає до академії ніндзя, щоб вивчити шляхи синобі. Він успадкував від свого батька буйний, шалений характер, проте не має наміру йти його стопами. Інші учні вже готові затаврувати його синком Хокаге, але хлопчик неодмінно доведе всім, що це не так! Боруто та його друзі мають розслідувати серію загадкових подій, що відбуваються в селі. Як вітер, що проноситься між листям, він прокладає шлях до серця кожної людини — його історія починається!