Доля/Великий наказ - Перший наказ

2015 рік. У світі все ще панує магія. Для збереження свого роду людство звело наукову лабораторію під назвою "Халдея". Суть її існування полягала в тому, щоб спостерігати за світом за допомогою тієї самої магії і досягнень людства. Завдяки зусиллям учених було підтверджено, що людству залишалося жити ще щонайменше 100 років. Однак "Халдея" зафіксувала якусь аномалію, внаслідок якої спостережувана лабораторією область майбутнього раптово зникла. Усі ці події призвели до паніки, і вчені почали вивчати отримані дані. З'ясувалося, що в місті Фуюкі 2004 року існувала область, яка жодного разу за всю історію існування "Халдеї" не потрапляла в поле її зору. Також підтвердилося вимирання людства вже 2017 року.
За результатами отриманих даних "Халдея" ухвалює рішення задіяти програму "Рейшифт". Сенс - відправити групу спеціально підготовлених людей (Майстрів) у минуле для ліквідації аномалії. Однак, у лабораторії стається вибух, і всі Майстри опиняються в критичному стані. Одному з них, Ріцуке Фудзімару, все ж вдається потрапити в минуле, де розгорталася легендарна війна за Святий Грааль. Тепер йому належить з'ясувати, що ж насправді сталося, і, за можливості, усунути загрозу.