30 років тому на китайсько-монгольському кордоні стався перший великий космічний викид, який спричинив величезну кількість жертв. 150 мільйонів людей загинули, проте з часом цей кошмар, названий Великою катастрофою, почав поступово забуватися. Щоправда, таємничі космовикиди тривають і донині, і вчені з усього світу марно намагаються з'ясувати їхнє походження. 16-річний Іцука Шидо живе в передмісті Токіо разом зі своєю навіженою молодшою сестричкою Которі, яка не дає йому ні хвилини спокою. Останнім часом на території Японії почастішали космічні викиди, і деякі з них були зовсім недалеко від місця, де мешкають Шидо і Которі. Одного разу, сидячи на уроці, Іцука чує сигнал тривоги, що сповіщає про черговий викид. Школярів просять сховатися в бункері, але Шидо вирушає на пошуки сестри, яка нехтує вимогами безпеки. Старшокласник потрапляє в епіцентр космовикиду, проте йому вдається вціліти. Іцука несподівано переміщується на борт Фраксінуса - бойового повітряного корабля, командиром якого є його сестра. Намагаючись зрозуміти, що тут відбувається, Шидо зіштовхується зі страшною правдою - Землі загрожує смертельна небезпека, і для того, щоб врятувати світ, він має закохати в себе дух, який спричиняє космічні викиди.