Фільм розповідає про події, що безпосередньо наступають за першим сезоном 'Пригод Дігімонів'. Діти, обрані 'цифровими чудовиськами', виконують свою місію і повертаються в реальний світ до звичайного життя: навчаються в школі, сваряться (особливо Таїті зі Сорою), знайомляться з новими людьми та подорожують. Проте історія на цьому не закінчується: через деякий час Косіро виявляє в інтернеті нове яйце дигімона, яке суцільно складається з системних помилок.
Запідозривши недобре, він прямує до Таїті, де разом із ним намагається зв'язатися з дигімонами, щоб отримати більше інформації про дивне яйце. Тим часом, новий дигімон встигає вилупитися і почати руйнувати бази даних по всьому світу, обваливши економіку кількох країн. Дигімони виходять на зв'язок з Таїті та Косіро, заявляючи, що з новачком все дуже просто: на діалог не піде, зупинятися у своїх діях не має наміру, ворожий навіть до представників свого вигляду.
Знаючи, що люди не мають технологій для боротьби з таким противником, дигімони погоджуються допомогти перемогти нового ворога, який уже непридатний до телефонної мережі і прагне дістатися управління ядерною зброєю. Однак 'вірусний' дигімон росте швидше за своїх побратимів, і на кожному етапі зростання перевершує їх за силою. Перемогти за рахунок чисельної переваги теж не вийде: через проблеми зі зв'язком обрані діти не можуть зібратися разом, а без них дигімони безсилі.