Японія вже понад 150 років перебуває у стані політичного хаосу. Якогось моменту з'являються люди, які намагаються об'єднати країну під контролем сьоґунату. Деспот і великий стратег Нобунага Ода, який першим заклав основи цієї форми управління державою, так і не зумів утримати владу. Кровопролитні битви продовжуються, і ніхто не збирається здаватися. Війна не закінчується навіть після знищення величезного робота, який був головною зброєю однієї із сторін. Саме в цей непростий час живе Ясуке, що пройшов шлях від слуги до самурая. Чоловік залишився вірним своєму пану, коли всі інші зрадили його. Незабаром Ясуке стає свідком його смерті — пан робить харакірі, попередньо призначивши Чорного самурая своїм кайсяком. Минає 20 років. Тепер Ясуке працює човнярем і намагається забути про кошмари війни, які весь цей час переслідують його ночами. Якось до нього звертається Ічика - жінка повідомляє, що її дочка смертельно хвора, і просить Чорного човняра відвезти їх до особливого лікаря. Сам того не бажаючи, Ясуке погоджується і незабаром розуміє, що хвора дівчинка набагато загадковіша, ніж здається на перший погляд.