Такаші Нацуме - трохи незвичайний хлопець, він живе своїм життям, практично ні з ким не говорить і бачить бісів, духів та іншу нечисть. Свої бачення він почав бачити в ранньому віці. Такаші намагався поділитися цією інформацією з батьками і друзями, але йому не вірили і вважали його трохи дивним. І ось, батьки юного духовидця померли, родичів у Такаші не залишилося, тож хлопець починає мандрувати країною. Нацуме не затримувався надовго в одному місці й постійно переїжджав. Близько місяця тому він оселився в будинку бабусі, яка ще давним давно померла. Після поселення в цьому будинку духи почали атакувати хлопця все частіше й частіше. Як виявилося, вони хотіли відібрати книгу Зошит дружби. Цю книгу вела бабуся Такаші, сюди вона записувала всіх переможених нею духів, але юний духовидець навіть і не думав здаватися. Такаші починає боротися з нечистю...